Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms