Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms