Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML1Q9UN30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms