Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCC3Q9ULS5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMCC3Q9ULS5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms