Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF490Q9ULM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF490Q9ULM2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms