Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED23Q9ULK4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms