Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZNF608Q9ULD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ZNF608Q9ULD9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms