Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms