Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms