Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms