Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX41Q9UJV9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX41Q9UJV9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms