Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms