Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF639Q9UID6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms