Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC3Q9UHC3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms