Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRRDQ9UH36 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms