Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms