Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5BQ9UGL1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5BQ9UGL1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms