Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DBF4Q9UBU7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms