Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A7Q9P2U7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms