Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms