Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9Q9P2J2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms