Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms