Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL20A1Q9P218 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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