Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms