Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms