Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms