Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLGN3Q9NZ94 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms