Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP39A1Q9NYL5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP39A1Q9NYL5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms