Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms