Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CWC25Q9NXE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms