Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms