Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAK1IP1Q9NWT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAK1IP1Q9NWT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAK1IP1Q9NWT1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAK1IP1Q9NWT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAK1IP1Q9NWT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAK1IP1Q9NWT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms