Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCLQ9NW38 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms