Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms