Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD4Q9NVD3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms