Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDFIP2Q9NV92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDFIP2Q9NV92 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms