Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms