Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms