Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms