Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLE3Q9NRF9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLE3Q9NRF9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms