Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
DUOX2Q9NRD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms