Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBN5Q9NRC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN5Q9NRC6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms