Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMRT3Q9NQL9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms