Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms