Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms