Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms