Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms