Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED4Q9NPJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MED4Q9NPJ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms