Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOPCQ9HD26 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GOPCQ9HD26 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOPCQ9HD26 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms