Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELP3Q9H9T3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ELP3Q9H9T3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms